Convergent genetic and expression data implicate immunity in Alzheimer's disease - CEA - Commissariat à l’énergie atomique et aux énergies alternatives Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Alzheimer's & Dementia : the Journal of the Alzheimer's Association Année : 2014

Convergent genetic and expression data implicate immunity in Alzheimer's disease

Lesley Jones (1) , Jean‐charles Lambert (2, 3) , Li‐san Wang , Seung‐hoan Choi , Denise Harold (4, 5) , Alexey Vedernikov , Valentina Escott‐price , Timothy Stone , Alexander Richards (4) , Céline Bellenguez (2) , Carla A Ibrahim‐verbaas , Adam C Naj (6) , Rebecca Sims (5) , Amy Gerrish (5) , Gyungah Jun (7) , Anita L Destefano (7) , Joshua C Bis (8) , Gary W Beecham (9) , Benjamin Grenier‐boley (2) , Giancarlo Russo (5) , Tricia A Thornton‐wells , Nicola Jones (5) , Albert V Smith (10) , Vincent Chouraki (2) , Charlene Thomas (11) , M. Arfan Ikram (12, 13) , Diana Zelenika (14) , Badri N Vardarajan (15) , Yoichiro Kamatani (14, 16) , Chiao‐feng Lin , Helena Schmidt (17) , Brian W Kunkle (18) , Melanie L Dunstan , Agustin Ruiz , Marie‐thérèse Bihoreau , Christiane Reitz , Florence Pasquier , Paul Hollingworth , Olivier Hanon (19) , Annette L Fitzpatrick , Joseph D Buxbaum , Dominique Campion (20) , Paul K Crane , Tim Becker , Vilmundur Gudnason , Carlos Cruchaga , David Craig , Najaf Amin , Claudine Berr (21) , Oscar L Lopez , Philip L de Jager , Vincent Deramecourt (22) , Janet A Johnston , Denis Evans , Simon Lovestone , Luc Letteneur , Johanes Kornhuber , Lluís Tárraga , David C Rubinsztein , Gudny Eiriksdottir , Kristel Sleegers , Alison M Goate , Nathalie Fiévet (2) , Matthew J Huentelman , Michael Gill , Valur Emilsson , Kristelle Brown , M. Ilyas Kamboh , Lina Keller , Pascale Barberger‐gateau (23) , Bernadette Mcguinness , Eric B Larson , Amanda J Myers , Carole Dufouil (23) , Stephen Todd , David Wallon (20) , Seth Love , Pat Kehoe , Ekaterina Rogaeva , John Gallacher , Peter St George‐hyslop , Jordi Clarimon , Alberti Lleò , Anthony Bayer , Debby W Tsuang , Lei Yu , Magda Tsolaki , Paola Bossù , Gianfranco Spalletta , Petra Proitsi , John Collinge , Sandro Sorbi , Florentino Sanchez Garcia , Nick Fox , John Hardy , Maria Candida Deniz Naranjo , Cristina Razquin , Paola Bosco , Robert Clarke , Carol Brayne , Daniela Galimberti , Michelangelo Mancuso , Susanne Moebus , Patrizia Mecocci , Maria del Zompo , Wolfgang Maier , Harald Hampel (24) , Alberto Pilotto , Maria Bullido , Francesco Panza , Paolo Caffarra , Benedetta Nacmias , John R Gilbert , Manuel Mayhaus , Frank Jessen , Martin Dichgans , Lars Lannfelt , Hakon Hakonarson , Sabrina Pichler , Minerva M Carrasquillo , Martin Ingelsson , Duane Beekly , Victoria Alavarez , Fanggeng Zou , Otto Valladares , Steven G Younkin , Eliecer Coto , Kara L Hamilton‐nelson , Ignacio Mateo , Michael J Owen , Kelley M Faber , Palmi V Jonsson , Onofre Combarros , Michael C O'Donovan , Laura B Cantwell , Hilkka Soininen , Deborah Blacker , Simon Mead , Thomas H Mosley , David A Bennett , Tamara B Harris , Laura Fratiglioni , Clive Holmes , Renee F a G de Bruijn , Peter Passmore , Thomas J Montine , Karolien Bettens , Jerome I Rotter , Alexis Brice (25, 26) , Kevin Morgan , Tatiana M Foroud , Walter A Kukull , Didier Hannequin (20) , John F Powell , Michael A Nalls , Karen Ritchie (21) , Kathryn L Lunetta , John S K Kauwe , Eric Boerwinkle , Matthias Riemenschneider , Mercè Boada , Mikko Hiltunen , Eden R Martin , Pau Pastor , Reinhold Schmidt , Dan Rujescu , Jean‐françois Dartigues (23, 27) , Richard Mayeux , Christophe Tzourio , Albert Hofman , Markus M Nöthen , Caroline Graff , Bruce M Psaty , Jonathan L Haines , Mark Lathrop (14, 28) , Margaret A Pericak‐vance , Lenore J Launer , Lindsay A Farrer , Cornelia M van Duijn , Christine van Broeckhoven , Alfredo Ramirez , Gerard D Schellenberg , Sudha Seshadri , Philippe Amouyel (2, 3, 29) , Julie Williams (11) , Peter A Holmans
1 MRC Centre for Neuropsychiatric Genetics and Genomics
2 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
3 Institut Pasteur de Lille
4 Cardiff University
5 Bioinformatics
6 HUP - Hospital of the University of Pennsylvania
7 BU - Boston University [Boston]
8 Department of Medicine
9 John P. Hussman Institute for Human Genomics
10 Icelandic Heart Association
11 Institute of Psychological Medicine and Clinical Neurosciences
12 Erasmus MC - Erasmus University Medical Center [Rotterdam]
13 Netherlands Consortium for Healthy Ageing, Leiden, The Netherlands
14 CNG - Centre National de Génotypage
15 Columbia University [New York]
16 RIKEN IMS - RIKEN Center for Integrative Medical Sciences [Yokohama]
17 Dpt of Pharmacology and Personalised Medicine [Maastricht]
18 John P. Hussman Institute for Human Genomics [Miami, FL, USA]
19 U894 - Centre de Psychiatrie et Neurosciences
20 Génétique médicale et fonctionnelle du cancer et des maladies neuropsychiatriques
21 Hôpital de la Colombière
22 RID-AGE - Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167
23 Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux]
24 IM2A - Institut de la Mémoire et de la Maladie d'Alzheimer [CHU Pitié-Salpétriêre]
25 CRICM - Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière
26 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
27 CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux]
28 CEPH - Fondation Jean Dausset - Centre d’Etudes du Polymorphisme Humain [Paris]
29 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
Li‐san Wang
  • Fonction : Auteur
Seung‐hoan Choi
  • Fonction : Auteur
Alexey Vedernikov
  • Fonction : Auteur
Valentina Escott‐price
  • Fonction : Auteur
Timothy Stone
  • Fonction : Auteur
Carla A Ibrahim‐verbaas
  • Fonction : Auteur
Rebecca Sims
  • Fonction : Auteur
Amy Gerrish
  • Fonction : Auteur
Giancarlo Russo
  • Fonction : Auteur
Tricia A Thornton‐wells
  • Fonction : Auteur
Nicola Jones
  • Fonction : Auteur
Chiao‐feng Lin
  • Fonction : Auteur
Melanie L Dunstan
  • Fonction : Auteur
Agustin Ruiz
  • Fonction : Auteur
Marie‐thérèse Bihoreau
  • Fonction : Auteur
Christiane Reitz
  • Fonction : Auteur
Florence Pasquier
  • Fonction : Auteur
Paul Hollingworth
  • Fonction : Auteur
Annette L Fitzpatrick
  • Fonction : Auteur
Joseph D Buxbaum
  • Fonction : Auteur
Paul K Crane
  • Fonction : Auteur
Tim Becker
  • Fonction : Auteur
Vilmundur Gudnason
  • Fonction : Auteur
Carlos Cruchaga
  • Fonction : Auteur
David Craig
  • Fonction : Auteur
Najaf Amin
  • Fonction : Auteur
Oscar L Lopez
  • Fonction : Auteur
Philip L de Jager
  • Fonction : Auteur
Janet A Johnston
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Denis Evans
  • Fonction : Auteur
Simon Lovestone
  • Fonction : Auteur
Luc Letteneur
  • Fonction : Auteur
Johanes Kornhuber
  • Fonction : Auteur
Lluís Tárraga
  • Fonction : Auteur
David C Rubinsztein
  • Fonction : Auteur
Gudny Eiriksdottir
  • Fonction : Auteur
Kristel Sleegers
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Alison M Goate
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Matthew J Huentelman
  • Fonction : Auteur
Michael Gill
  • Fonction : Auteur
Valur Emilsson
  • Fonction : Auteur
Kristelle Brown
  • Fonction : Auteur
M. Ilyas Kamboh
  • Fonction : Auteur
Lina Keller
  • Fonction : Auteur
Bernadette Mcguinness
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Eric B Larson
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Amanda J Myers
  • Fonction : Auteur
Stephen Todd
  • Fonction : Auteur
Seth Love
  • Fonction : Auteur
Pat Kehoe
  • Fonction : Auteur
Ekaterina Rogaeva
  • Fonction : Auteur
John Gallacher
  • Fonction : Auteur
Peter St George‐hyslop
  • Fonction : Auteur
Jordi Clarimon
  • Fonction : Auteur
Alberti Lleò
  • Fonction : Auteur
Anthony Bayer
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Debby W Tsuang
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Lei Yu
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Magda Tsolaki
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Paola Bossù
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Gianfranco Spalletta
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Petra Proitsi
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John Collinge
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Sandro Sorbi
  • Fonction : Auteur
Florentino Sanchez Garcia
  • Fonction : Auteur
Nick Fox
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John Hardy
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Maria Candida Deniz Naranjo
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Cristina Razquin
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Paola Bosco
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Robert Clarke
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Carol Brayne
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Daniela Galimberti
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Michelangelo Mancuso
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Susanne Moebus
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Patrizia Mecocci
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Maria del Zompo
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Wolfgang Maier
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Alberto Pilotto
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Maria Bullido
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Francesco Panza
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Paolo Caffarra
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Benedetta Nacmias
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John R Gilbert
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Manuel Mayhaus
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Frank Jessen
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Martin Dichgans
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Lars Lannfelt
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Hakon Hakonarson
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Sabrina Pichler
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Minerva M Carrasquillo
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Martin Ingelsson
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Duane Beekly
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Victoria Alavarez
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Fanggeng Zou
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Otto Valladares
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Steven G Younkin
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Eliecer Coto
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Kara L Hamilton‐nelson
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Ignacio Mateo
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Michael J Owen
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Kelley M Faber
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Palmi V Jonsson
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Onofre Combarros
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Michael C O'Donovan
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Laura B Cantwell
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Hilkka Soininen
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Deborah Blacker
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Simon Mead
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Thomas H Mosley
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David A Bennett
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Tamara B Harris
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Laura Fratiglioni
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Clive Holmes
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Renee F a G de Bruijn
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Peter Passmore
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Thomas J Montine
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Karolien Bettens
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Jerome I Rotter
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Kevin Morgan
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Tatiana M Foroud
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Walter A Kukull
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John F Powell
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Michael A Nalls
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Kathryn L Lunetta
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John S K Kauwe
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Eric Boerwinkle
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Matthias Riemenschneider
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Mercè Boada
  • Fonction : Auteur
Mikko Hiltunen
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Eden R Martin
  • Fonction : Auteur
Pau Pastor
  • Fonction : Auteur
Reinhold Schmidt
  • Fonction : Auteur
Dan Rujescu
  • Fonction : Auteur
Richard Mayeux
  • Fonction : Auteur
Christophe Tzourio
  • Fonction : Auteur
Albert Hofman
  • Fonction : Auteur
Markus M Nöthen
  • Fonction : Auteur
Caroline Graff
  • Fonction : Auteur
Bruce M Psaty
  • Fonction : Auteur
Jonathan L Haines
  • Fonction : Auteur
Margaret A Pericak‐vance
  • Fonction : Auteur
Lenore J Launer
  • Fonction : Auteur
Lindsay A Farrer
  • Fonction : Auteur
Cornelia M van Duijn
  • Fonction : Auteur
Christine van Broeckhoven
  • Fonction : Auteur
Alfredo Ramirez
  • Fonction : Auteur
Gerard D Schellenberg
  • Fonction : Auteur
Sudha Seshadri
  • Fonction : Auteur
Peter A Holmans
  • Fonction : Auteur

Résumé

Background Late‐onset Alzheimer's disease (AD) is heritable with 20 genes showing genome‐wide association in the International Genomics of Alzheimer's Project (IGAP). To identify the biology underlying the disease, we extended these genetic data in a pathway analysis. Methods The ALIGATOR and GSEA algorithms were used in the IGAP data to identify associated functional pathways and correlated gene expression networks in human brain. Results ALIGATOR identified an excess of curated biological pathways showing enrichment of association. Enriched areas of biology included the immune response ( P = 3.27 × 10 −12 after multiple testing correction for pathways), regulation of endocytosis ( P = 1.31 × 10 −11 ), cholesterol transport ( P = 2.96 × 10 −9 ), and proteasome‐ubiquitin activity ( P = 1.34 × 10 −6 ). Correlated gene expression analysis identified four significant network modules, all related to the immune response (corrected P = .002–.05). Conclusions The immune response, regulation of endocytosis, cholesterol transport, and protein ubiquitination represent prime targets for AD therapeutics.
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Lesley Jones, Jean‐charles Lambert, Li‐san Wang, Seung‐hoan Choi, Denise Harold, et al.. Convergent genetic and expression data implicate immunity in Alzheimer's disease. Alzheimer's & Dementia : the Journal of the Alzheimer's Association, 2014, 11 (6), pp.658 - 671. ⟨10.1016/j.jalz.2014.05.1757⟩. ⟨cea-04587244⟩
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