ADN et ARN environnementaux : découverte et fonctions
Résumé
La détection simultanée d’ADN et d’ARN dans l’environnement permet théoriquement de définir l’activité d’un organisme dans une condition donnée et de la comparer à son potentiel codant. Une autre application est de détecter des virus à ARN inconnus et les génomes de leurs hôtes putatifs. Les génomes présents peuvent être reconstitués, ouvrant la voie à une analyse génomique d’organismes incultivés, ainsi que de leurs symbiontes et pathogènes. En prenant pour exemple des écosystèmes aquatiques, nous montrons qu’il est possible avec les méthodes récentes d’analyser les génomes d’organisme présents et d’étudier leur transcription, afin d’étudier à l’échelle du gène la variation spatiale et temporelle de ces communautés.