Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer - Institut de Biologie François JACOB Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue EBioMedicine Année : 2023

Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer

Timo Hess (1, 2) , Carlo Maj (1, 2) , Jan Gehlen (1) , Oleg Borisov (2) , Stephan Haas (3) , Ines Gockel (4) , Michael Vieth (5) , Guillaume Piessen (6) , Hakan Alakus (7) , Yogesh Vashist (8, 9) , Carina Pereira (10) , Michael Knapp (11) , Vitalia Schüller (1) , Alexander Quaas (12) , Heike Grabsch (13) , Jessica Trautmann (2) , Ewa Malecka-Wojciesko (14) , Anna Mokrowiecka (14) , Jan Speller (2) , Andreas Mayr (2) , Julia Schröder (2) , Axel Hillmer (15) , Dominik Heider (1) , Florian Lordick (4) , Ángeles Pérez-Aísa (16) , Rafael Campo (17) , Jesús Espinel (18) , Fernando Geijo (19) , Concha Thomson , Luis Bujanda (20, 21) , Federico Sopeña (20, 22, 23) , Ángel Lanas (20) , María Pellisé (20) , Claudia Pauligk , Thorsten Oliver Goetze , Carolin Zelck (1) , Julian Reingruber (1) , Emadeldin Hassanin (2) , Peter Elbe (24, 25) , Sandra Alsabeah (25, 24) , Mats Lindblad (25, 24) , Magnus Nilsson (25, 24) , Nicole Kreuser (4) , René Thieme (4) , Francesca Tavano (26) , Roberta Pastorino , Dario Arzani , Roberto Persiani , Jin-On Jung , Henrik Nienhüser , Katja Ott , Ralf Schumann , Oliver Kumpf , Susen Burock , Volker Arndt , Anna Jakubowska , Małgorzta Ławniczak , Victor Moreno , Vicente Martín , Manolis Kogevinas , Marina Pollán , Justyna Dąbrowska , Antonio Salas , Olivier Cussenot , Anne Boland-Auge (27) , Delphine Daian (27) , Jean-Francois Deleuze (27) , Erika Salvi , Maris Teder-Laving , Gianluca Tomasello , Margherita Ratti , Chiara Senti , Valli de Re , Agostino Steffan , Arnulf Hölscher , Katharina Messerle , Christiane Josephine Bruns , Armands Sīviņš , Inga Bogdanova , Jurgita Skieceviciene , Justina Arstikyte , Markus Moehler , Hauke Lang , Peter Grimminger , Martin Kruschewski , Nikolaos Vassos , Claus Schildberg , Philipp Lingohr , Karsten Ridwelski , Hans Lippert , Nadine Fricker , Peter Krawitz , Per Hoffmann , Markus Nöthen , Lothar Veits , Jakob Izbicki , Adrianna Mostowska , Federico Martinón-Torres , Daniele Cusi , Rolf Adolfsson , Geraldine Cancel-Tassin , Aksana Höblinger , Ernst Rodermann , Monika Ludwig , Gisela Keller , Andres Metspalu , Hermann Brenner , Joerg Heller , Markus Neef , Michael Schepke , Franz Ludwig Dumoulin , Lutz Hamann , Renato Cannizzaro , Michele Ghidini , Dominik Plaßmann , Michael Geppert , Peter Malfertheiner , Olivier Gehlen , Tomasz Skoczylas , Marek Majewski , Jan Lubiński , Orazio Palmieri , Stefania Boccia , Anna Latiano , Nuria Aragones , Thomas Schmidt , Mário Dinis-Ribeiro , Rui Medeiros , Salah-Eddin Al-Batran , Mārcis Leja , Juozas Kupcinskas , María García-González (20, 22, 28) , Marino Venerito (29) , Johannes Schumacher (1)
1 Philipps Universität Marburg = Philipps University of Marburg
2 Universität Bonn = University of Bonn
3 USC - University of Southern California
4 University Hospital Leipzig = Universitätsklinikum Leipzig
5 FAU - Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg = University of Erlangen-Nuremberg
6 Hôpital Claude Huriez [Lille]
7 University of Cologne
8 UKE - Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg]
9 University of Hamburg
10 IPO Porto - Instituto Português de Oncologia do Porto / Portuguese Oncology Institute of Porto
11 KIT - Karlsruhe Institute of Technology
12 Departamento de Matematica [Valparaiso]
13 MUMC - Maastricht University Medical Centre
14 MUL - Medical University of Łódź
15 University Hospital of Cologne [Cologne]
16 Hospital Costa del Sol
17 HUPT - Hospital Universitari Parc Taulí [Sabadell, Spain]
18 CHUS - Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela [Saint-Jacques-de-Compostelle, Espagne]
19 Hospital Clinico Universitario de Salamanca
20 CIBERehd - Centro de Investigación Biomédica en Red en el Área temática de Enfermedades Hepáticas y Digestivas
21 UPV/EHU - Universidad del Pais Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea [Espagne]
22 IIS Aragón - Instituto de Investigación Sanitaria de Aragón [Zaragoza]
23 Hospital Clínico Universitario “Lozano Blesa” [Zaragoza, Spain]
24 Karolinska University Hospital [Stockholm]
25 Karolinska Institutet [Stockholm]
26 IRCCS - Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza [San Giovanni Rotondo]
27 CNRGH - Centre National de Recherche en Génomique Humaine
28 IACS - Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud [Zaragoza]
29 OVGU - Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg = Otto-von-Guericke University [Magdeburg]
Guillaume Piessen
Hakan Alakus
Concha Thomson
  • Fonction : Auteur
Claudia Pauligk
  • Fonction : Auteur
Thorsten Oliver Goetze
  • Fonction : Auteur
Roberta Pastorino
  • Fonction : Auteur
Dario Arzani
  • Fonction : Auteur
Roberto Persiani
  • Fonction : Auteur
Jin-On Jung
Henrik Nienhüser
  • Fonction : Auteur
Katja Ott
  • Fonction : Auteur
Ralf Schumann
  • Fonction : Auteur
Oliver Kumpf
  • Fonction : Auteur
Susen Burock
  • Fonction : Auteur
Volker Arndt
  • Fonction : Auteur
Anna Jakubowska
  • Fonction : Auteur
Małgorzta Ławniczak
  • Fonction : Auteur
Victor Moreno
  • Fonction : Auteur
Vicente Martín
  • Fonction : Auteur
Manolis Kogevinas
  • Fonction : Auteur
Marina Pollán
  • Fonction : Auteur
Justyna Dąbrowska
  • Fonction : Auteur
Antonio Salas
  • Fonction : Auteur
Olivier Cussenot
  • Fonction : Auteur
Erika Salvi
  • Fonction : Auteur
Maris Teder-Laving
  • Fonction : Auteur
Gianluca Tomasello
  • Fonction : Auteur
Margherita Ratti
  • Fonction : Auteur
Chiara Senti
  • Fonction : Auteur
Valli de Re
  • Fonction : Auteur
Agostino Steffan
  • Fonction : Auteur
Arnulf Hölscher
  • Fonction : Auteur
Katharina Messerle
  • Fonction : Auteur
Christiane Josephine Bruns
  • Fonction : Auteur
Armands Sīviņš
  • Fonction : Auteur
Inga Bogdanova
  • Fonction : Auteur
Jurgita Skieceviciene
  • Fonction : Auteur
Justina Arstikyte
  • Fonction : Auteur
Markus Moehler
  • Fonction : Auteur
Hauke Lang
  • Fonction : Auteur
Peter Grimminger
  • Fonction : Auteur
Martin Kruschewski
  • Fonction : Auteur
Nikolaos Vassos
  • Fonction : Auteur
Claus Schildberg
  • Fonction : Auteur
Philipp Lingohr
  • Fonction : Auteur
Karsten Ridwelski
  • Fonction : Auteur
Hans Lippert
  • Fonction : Auteur
Nadine Fricker
  • Fonction : Auteur
Peter Krawitz
  • Fonction : Auteur
Per Hoffmann
  • Fonction : Auteur
Markus Nöthen
  • Fonction : Auteur
Lothar Veits
  • Fonction : Auteur
Jakob Izbicki
  • Fonction : Auteur
Adrianna Mostowska
Federico Martinón-Torres
  • Fonction : Auteur
Daniele Cusi
  • Fonction : Auteur
Rolf Adolfsson
  • Fonction : Auteur
Geraldine Cancel-Tassin
  • Fonction : Auteur
Aksana Höblinger
  • Fonction : Auteur
Ernst Rodermann
  • Fonction : Auteur
Monika Ludwig
  • Fonction : Auteur
Gisela Keller
  • Fonction : Auteur
Andres Metspalu
  • Fonction : Auteur
Hermann Brenner
  • Fonction : Auteur
Joerg Heller
  • Fonction : Auteur
Markus Neef
  • Fonction : Auteur
Michael Schepke
  • Fonction : Auteur
Franz Ludwig Dumoulin
  • Fonction : Auteur
Lutz Hamann
  • Fonction : Auteur
Renato Cannizzaro
Michele Ghidini
  • Fonction : Auteur
Dominik Plaßmann
  • Fonction : Auteur
Michael Geppert
  • Fonction : Auteur
Peter Malfertheiner
  • Fonction : Auteur
Olivier Gehlen
  • Fonction : Auteur
Tomasz Skoczylas
  • Fonction : Auteur
Marek Majewski
  • Fonction : Auteur
Jan Lubiński
  • Fonction : Auteur
Orazio Palmieri
Stefania Boccia
  • Fonction : Auteur
Anna Latiano
  • Fonction : Auteur
Nuria Aragones
  • Fonction : Auteur
Thomas Schmidt
  • Fonction : Auteur
Mário Dinis-Ribeiro
  • Fonction : Auteur
Rui Medeiros
  • Fonction : Auteur
Salah-Eddin Al-Batran
  • Fonction : Auteur
Mārcis Leja
  • Fonction : Auteur
Juozas Kupcinskas
  • Fonction : Auteur

Résumé

Background Gastric cancer (GC) is clinically heterogenous according to location (cardia/non-cardia) and histopathology (diffuse/intestinal). We aimed to characterize the genetic risk architecture of GC according to its subtypes. Another aim was to examine whether cardia GC and oesophageal adenocarcinoma (OAC) and its precursor lesion Barrett’s oesophagus (BO), which are all located at the gastro-oesophageal junction (GOJ), share polygenic risk architecture. Methods We did a meta-analysis of ten European genome-wide association studies (GWAS) of GC and its subtypes. All patients had a histopathologically confirmed diagnosis of gastric adenocarcinoma. For the identification of risk genes among GWAS loci we did a transcriptome-wide association study (TWAS) and expression quantitative trait locus (eQTL) study from gastric corpus and antrum mucosa. To test whether cardia GC and OAC/BO share genetic aetiology we also used a European GWAS sample with OAC/BO. Findings Our GWAS consisting of 5816 patients and 10,999 controls highlights the genetic heterogeneity of GC according to its subtypes. We newly identified two and replicated five GC risk loci, all of them with subtype-specific association. The gastric transcriptome data consisting of 361 corpus and 342 antrum mucosa samples revealed that an upregulated expression of MUC1, ANKRD50, PTGER4, and PSCA are plausible GC-pathomechanisms at four GWAS loci. At another risk locus, we found that the blood-group 0 exerts protective effects for non-cardia and diffuse GC, while blood-group A increases risk for both GC subtypes. Furthermore, our GWAS on cardia GC and OAC/BO (10,279 patients, 16,527 controls) showed that both cancer entities share genetic aetiology at the polygenic level and identified two new risk loci on the single-marker level. Interpretation Our findings show that the pathophysiology of GC is genetically heterogenous according to location and histopathology. Moreover, our findings point to common molecular mechanisms underlying cardia GC and OAC/BO.
Fichier principal
Vignette du fichier
1-s2.0-S2352396423001810-main.pdf (1.5 Mo) Télécharger le fichier
1-s2.0-S2352396423002748-main.pdf (226.82 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
licence : CC BY NC ND - Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
licence : CC BY NC ND - Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification

Dates et versions

cea-04342499 , version 1 (13-12-2023)

Licence

Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification

Identifiants

Citer

Timo Hess, Carlo Maj, Jan Gehlen, Oleg Borisov, Stephan Haas, et al.. Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer. EBioMedicine, 2023, 92, pp.104616. ⟨10.1016/j.ebiom.2023.104616⟩. ⟨cea-04342499⟩
20 Consultations
4 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More