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Phage-Plasmids Spread Antibiotic Resistance Genes through Infection and Lysogenic Conversion
Eugen Pfeifer
,
Rémy A. Bonnin
,
Eduardo Rocha
Article dans une revue
pasteur-03818031v1
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Bacillus subtilis, the model Gram-positive bacterium: 20years of annotation refinement
Rainer Borriss
,
Antoine Danchin
,
Colin R. Harwood
,
Claudine Médigue
,
Eduardo P. C. Rocha
,
et al.
Article dans une revue
cea-02291345v1
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Whole genome-based population biology and epidemiological surveillance of Listeria monocytogenes
Alexandra Moura
,
Alexis Criscuolo
,
Hannes Pouseele
,
Mylène M. Maury
,
Alexandre Leclercq
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01415883v1
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Experimental evolution of rhizobia may lead to either extra- or intracellular symbiotic adaptation depending on the selection regime
Marta Marchetti
,
Camille Clerissi
,
Yasmine Yousfi
,
Carine Gris
,
Olivier Bouchez
,
et al.
Article dans une revue
hal-01607703v1
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Recruitment of a Lineage-Specific Virulence Regulatory Pathway Promotes Intracellular Infection by a Plant Pathogen Experimentally Evolved into a Legume Symbiont
Delphine Capela
,
Marta Marchetti
,
Camille Clerissi
,
Anthony Perrier
,
Dorian Guetta
,
et al.
Article dans une revue
hal-02620519v1
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Transient Hypermutagenesis Accelerates the Evolution of Legume Endosymbionts following Horizontal Gene Transfer
Philippe Remigi
,
Delphine Capela
,
Camille Clerissi
,
Léna Tasse
,
Rachel Torchet
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01374959v1
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
Guillaume Gautreau
,
Adelme Bazin
,
Mathieu Gachet
,
Rémi Planel
,
Laura Burlot
,
et al.
Article dans une revue
hal-03089210v1
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a Partitioned Pangenome Graph
Guillaume Gautreau
,
Christophe Ambroise
,
Catherine Matias
,
Amandine Perrin
,
Rémi Planel
,
et al.
Genome Informatics 2018, Sep 2018, Hinxton, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-04356757v1
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PanGBank: depicting microbial species diversity via PPanGGOLiN
Guillaume Gautreau
,
Adelme Bazin
,
Rémi Planel
,
Mathieu Gachet
,
Mathieu Dubois
,
et al.
JOBIM 2019 Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France
Poster de conférence
hal-04358380v1
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CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins
David Couvin
,
Aude Bernheim
,
Claire Toffano-Nioche
,
Marie Touchon
,
Juraj Michalik
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-02098389v1
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Complete Genome Sequence of the Fish Pathogen Flavobacterium branchiophilum
M. Touchon
,
P. Barbier
,
J.-F. Bernardet
,
V. Loux
,
Benoît Vacherie
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01374942v1
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Complete genome sequence of Flavobacterium indicum GPSTA100-9T, isolated from warm spring water
Paul Barbier
,
Armel A. Houel
,
Valentin Loux
,
Julie Poulain
,
Jean-François Bernardet
,
et al.
Article dans une revue
hal-02643519v1
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Capsules and their traits shape phage susceptibility and plasmid conjugation efficiency
Matthieu Haudiquet
,
Julie Le Bris
,
Amandine Nucci
,
Rémy A Bonnin
,
Pilar Domingo-Calap
,
et al.
Article dans une revue
hal-04492345v1
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CRISPRCasdb a successor of CRISPRdb containing CRISPR arrays and cas genes from complete genome sequences, and tools to download and query lists of repeats and spacers
Christine Pourcel
,
Marie Touchon
,
Nicolas Villeriot
,
Jean-Philippe Vernadet
,
David Couvin
,
et al.
Article dans une revue
hal-02990278v1
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Adaptation mechanisms of Clostridioides difficile to auranofin and its impact on human gut microbiota
Cyril Anjou
,
Marie Royer
,
Émilie Bertrand
,
Marius Bredon
,
Julie Le Bris
,
et al.
Article dans une revue
hal-04756892v1
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a Partitioned Pangenome Graph
Guillaume Gautreau
,
Christophe Ambroise
,
Catherine Matias
,
Amandine Perrin
,
Rémi Planel
,
et al.
JOBIM 2018 Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-04355945v1
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Spread of carbapenemase-producing Morganella spp from 2013 to 2021: a comparative genomic study
Rémy Bonnin
,
Elodie Creton
,
Amandine Perrin
,
Delphine Girlich
,
Cecile Emeraud
,
et al.
Article dans une revue
hal-04629647v1
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Les applications antibactériennes des bactériophages
Mireille Ansaldi
,
Pascale Boulanger
,
Charlotte Brives
,
Claire Le Hénaff
,
Laurent Debarbieux
,
et al.
Article dans une revue
hal-02530998v1
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Parallels between experimental and natural evolution of legume symbionts
Camille Clerissi
,
Marie Touchon
,
Delphine Capela
,
Mingxing Tang
,
Stéphane Cruveiller
,
et al.
Article dans une revue
cea-01880286v1
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Author Correction : Parallels between experimental and natural evolution of legume symbionts (vol 9, 2264, 2018)
Camille Clerissi
,
Marie Touchon
,
Delphine Capela
,
Mingxing Tang
,
Stéphane Cruveiller
,
et al.
Article dans une revue
hal-02617830v1
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